Софора японская представляет собой листопадное дерево высотой 20-25 м. Она имеет раскидистую, шарообразную или зонтичную крону. Скелетные ветки растут горизонтально, первые расположены достаточно низко. Все одревесневшие части покрыты плотной корой тёмно-серого оттенка с глубокими трещинами.